Em 1879 foi celebrada a primeira Missa, em Okauva, no território que hoje constitui a Diocese de Ondjiva. Graças ao abnegado trabalhado dos missionários Espiritanos teve início a primeira fase de evangelização do Kunene.

Durante essa fase, marcada pelas primeiras tentativas de implantação missionária, foram criadas as Missões de Santa Maria Mãe de Deus-Humbe (1882), S. Miguel do Cuanhama – Okauva (1983), Matadiva (1900), Tchipelongo (1901), Oupyakadi (1904), Nakaheke
(1912), Mupa Morro (1913), Missões essas que, devido a dificuldades de vária ordem, deixaram de funcionar.

A segunda fase começa em 1916 com as fundações das Missões do Chiulo, Mupa (1923) e Omupanda (1928). Foram a partir destas Missões que a evangelização tornou-se efectiva, enraizando-se em Ondjiva.

A Diocese de Ondjiva foi erecta a 10 de Agosto de 1975, com a designação de Diocese de Pereira D’Eça, pelo Papa Paulo VI, através da Bula “Quoniam Apprime Animorum”. Alcançada a independência de Angola, o nome de Pereira d’Eça foi substituído pelo nome Diocese de Ondjiva. Por isso, a Santa Sé, a 16 de Maio de 1979, ratificou a mudança operada, e a Igreja passou a chamar-se Diocese de Ondjiva.

Foram Pastores da Diocese de Ondjiva:
1- D. Eurico Dias Nogueira – Bispo de Sá da Bandeira (Lubango) e Administrador Apostólico de Ondjiva (1975-1977)

2- D. Alexandre do Nascimento – Arcebispo do Lubango e Administrador Apostólico de Ondjiva (1977-1980)

3- Monsenhor Fernando Guimarães Kevanu – Administrador Apostólico de Ondjiva (de 12 de Setembro de 1986 a 14 de Abril de 1988); Aos 03 de Julho de 1988 recebeu a Ordenação Episcopal, tomou posse aos 10 de Julho do mesmo ano, como primeiro bispo diocesano de Ondjiva, tendo renunciado ao governo pastoral da Diocese aos 23 de Novembro de 2011.

4- D. Pio Hipunyati – 2012….

• Actualmente a Diocese conta com: Santuário: 1 ( Nossa Senhora da Assunção- Eko)
• Paróquias: 15 Sacerdotes
• Diocesanos: 49
• Centros Pastorais: 23
• Sacerdotes religiosos: 5
• Diácono: 1
• Seminários: 2 (Dom Bosco – Menor e Imaculado Coração de MariaPropedêutico)
  Congregações religiosas masculinas: 3
  Congregações/ Institutos /Associações/ (femininas) de vida religiosa: 13
  Sociedade de vida Apostólica: 1